補正機能が働いた場合、オリジナルのデータへの影響はありますか

影響はありません。Vidchecker は元の入力ファイルを変更せずにそのまま残します。修正されたファイルが Vidchecker によって作成された場合、これは新しいファイルとして別のファイル名で保存されます（通常は元のファイル名に日付と時刻が付いていますが、他のサフィックスを追加する事もできます）